DNA non-coding yang terletak di luar kromosom dapat membantu mendorong glioblastoma – ScienceDaily

DNA non-coding yang terletak di luar kromosom dapat membantu mendorong glioblastoma – ScienceDaily


Salah satu cara gen penyebab kanker menghasilkan daya yang cukup untuk mengubah sel normal menjadi sel kanker adalah dengan menyalin dirinya sendiri berulang kali, seperti mesin Xerox. Para ilmuwan telah lama memperhatikan bahwa ketika gen penyebab kanker melakukan itu, mereka juga mengambil beberapa DNA tambahan ke dalam salinannya. Tetapi masih belum jelas apakah DNA tambahan membantu mendorong kanker atau hanya untuk perjalanan.

Dengan menggunakan sampel tumor otak glioblastoma manusia, para peneliti di Fakultas Kedokteran Universitas California San Diego dan Fakultas Kedokteran Universitas Case Western Reserve kini telah menentukan bahwa semua DNA ekstra itu sangat penting untuk mempertahankan aktivasi gen penyebab kanker, dan pada akhirnya mendukung kanker. kemampuan sel untuk bertahan hidup. Membandingkan temuan tersebut dengan database publik dari genetika tumor pasien, mereka juga menemukan bahwa meskipun dua jenis tumor yang berbeda didorong oleh gen penyebab kanker yang sama, DNA tambahan mungkin berbeda.

Studi yang dipublikasikan pada 21 November 2019 di Sel, dapat menjelaskan mengapa obat sering berhasil untuk beberapa jenis kanker tetapi tidak untuk yang lain.

“Kami telah menargetkan gen penyebab kanker untuk terapi, tetapi ternyata kami juga harus berpikir tentang menargetkan sakelar yang dibawa bersamanya,” kata rekan penulis senior Peter Scacheri, PhD, Profesor Onkologi Gertrude Donnelly Hess. di Fakultas Kedokteran Universitas Case Western Reserve dan anggota dari Pusat Kanker Komprehensif Kasus.

Ketika genom manusia pertama kali diurutkan secara lengkap, banyak orang yang terkejut karena ternyata mengandung jauh lebih sedikit gen – segmen DNA yang menyandikan protein – dari yang diharapkan. Ternyata sisa DNA manusia dalam genom, daerah non-pengkode, memainkan peran penting dalam mengatur dan meningkatkan gen penyandi protein – mengaktifkan dan menonaktifkannya, misalnya.

Dalam penelitian ini, para peneliti memfokuskan pada salah satu contoh gen penyebab kanker, EGFR, yang sangat aktif dalam glioblastoma, bentuk agresif dari kanker otak, dan kanker lainnya. Saat salinan EGFR menumpuk di tumor, mereka cenderung berbentuk DNA melingkar, terpisah dari kromosom.

“Pada tahun 2004, saya memimpin uji klinis pertama yang menguji penghambat molekul kecil EGFR di glioblastoma, “kata rekan penulis senior Jeremy Rich, MD, profesor kedokteran di UC San Diego School of Medicine dan direktur neuro-onkologi dan direktur Institut Tumor Otak di UC San Diego Health.” Tapi itu tidak berhasil . Dan di sinilah kita 15 tahun kemudian, masih mencoba memahami mengapa tumor otak tidak merespons penghambat dari apa yang tampaknya menjadi salah satu gen terpenting untuk membuat kanker ini tumbuh. “

Tim mengamati lebih dekat DNA ekstra di sekitarnya EGFR lingkaran di 9 dari 44 sampel tumor glioblastoma berbeda yang disumbangkan oleh pasien yang menjalani operasi. Mereka menemukan bahwa lingkaran tersebut berisi sebanyak 20 hingga 50 penguat dan elemen pengaturan lainnya. Beberapa elemen regulasi telah berdekatan EGFR dalam genom, tetapi yang lain ditarik dari daerah lain dari genom.

Untuk menentukan peran yang dimainkan setiap elemen regulasi, para peneliti membungkamnya satu per satu. Mereka menyimpulkan bahwa hampir setiap elemen pengaturan berkontribusi pada pertumbuhan tumor.

“Sepertinya gen penyebab kanker mengambil sebanyak mungkin saklar yang bisa dilakukan … mengkooptasi aktivitas normal mereka untuk memaksimalkan ekspresinya sendiri,” kata Scacheri.

Penulis pertama Andrew Morton, seorang mahasiswa pascasarjana di lab Scacheri, kemudian mencari database publik informasi genetik tumor pasien – lebih dari 4.500 catatan yang mencakup sembilan jenis kanker yang berbeda. Ia menemukan bahwa pengamatan tim tidak terbatas EGFR dan glioblastoma. Enhancer diperkuat bersama gen penyebab kanker di banyak tumor, terutama MYC gen di medulloblastoma dan MYCN di tumor neuroblastoma dan Wilms.

“Orang mengira bahwa jumlah salinan yang tinggi saja menjelaskan tingkat aktivitas yang tinggi dari gen penyebab kanker, tapi itu karena orang tidak benar-benar melihat pada penguat,” kata Morton. “Bidang ini benar-benar terpusat pada gen hingga saat ini, dan sekarang kami mengambil pandangan yang lebih luas.”

Selanjutnya, para peneliti ingin mengetahui apakah keragaman elemen pengaturan di seluruh jenis kanker juga dapat membantu tumor berkembang dan melawan kemoterapi. Mereka juga berharap menemukan kelas obat terapeutik yang menghambat elemen pengaturan ini, menyediakan cara lain untuk mengerem gen penyebab kanker.

“Ini bukan hanya fenomena laboratorium, ini adalah informasi yang saya butuhkan untuk merawat pasien saya dengan lebih baik,” kata Rich, yang juga anggota fakultas di Konsorsium Sanford untuk Pengobatan Regeneratif dan Sanford Stem Cell Clinical Center di UC San Diego Health.

Rekan penulis studi tambahan termasuk: Nergiz Dogan-Artun, Pusat Kanker Putri Margaret, Jaringan Kesehatan Universitas; Zachary J. Faber, Cynthia F. Bartels, Kevin C. Allan, Universitas Case Western Reserve; Graham MacLeod, Stephane Angers, Universitas Toronto; Megan S. Piazza, Shashirekha Shetty, Rumah Sakit Universitas, Cleveland; Stephen C. Mack, Sekolah Tinggi Kedokteran Baylor; Xiuxing Wang, Qiulian Wu, UC San Diego; Ryan C. Gimple, UC San Diego dan Case Western Reserve University; Brian P. Rubin, Klinik Cleveland; Peter B. Dirks, Rumah Sakit untuk Anak-anak yang Sakit, Institut Riset Kanker Ontario; Richard C. Sallari, Axiotl, Inc .; Mathieu Lupien, Pusat Kanker Putri Margaret, Jaringan Kesehatan Universitas, Institut Penelitian Kanker Ontario, Universitas Toronto.

Untuk Informasi Lebih lanjut silahkan Kunjungi : Pengeluaran SGP

Author Image
adminProzen