Identifikasi faktor virus yang merusak respons kekebalan pada pasien COVID-19 – ScienceDaily

Identifikasi faktor virus yang merusak respons kekebalan pada pasien COVID-19 – ScienceDaily


Pada Oktober 2020, SARS-CoV-2 menyebabkan pandemi berkelanjutan, dengan lebih dari 35 juta kasus yang dilaporkan dan lebih dari 1 juta kematian di seluruh dunia. Salah satu ciri menonjol yang membedakan COVID-19 dari SARS dalam hal tanggapan kekebalan adalah induksi yang buruk dari tanggapan interferon tipe I (IFN) oleh SARS-CoV-2 dibandingkan dengan SARS-CoV dan virus influenza A. Khususnya, tanggapan IFN yang terganggu dikaitkan dengan penyakit COVID-19. Namun, mekanisme molekuler yang mendasari tanggapan IFN yang tidak efisien pada infeksi SARS-CoV-2 masih belum jelas.

Sebuah tim peneliti di The Institute of Medical Science, The University of Tokyo (IMSUT) bertujuan untuk mengkarakterisasi faktor virus yang menentukan aktivasi kekebalan pada infeksi SARS-CoV-2 dan menemukan bahwa ORF3b, gen yang dikodekan oleh SARS-CoV-2 , adalah antagonis IFN yang kuat.

“Tanggapan IFN yang buruk pada pasien COVID-19 mungkin dijelaskan oleh tindakan produk virus ini, ORF3b,” kata pemimpin ilmuwan, Kei Sato, Profesor Madya (Peneliti Utama) di Divisi Sistem Virologi, Departemen Pengendalian Penyakit Menular, IMSUT.

Hasil penelitian ini dipublikasikan di “Laporan Sel“pada 4 September 2020.

ORF3b sebagai antagonis IFN virus

Meskipun infeksi SARS-CoV menyebabkan pneumonia akut dan berat, infeksi SARS-CoV-2 dapat terjadi tanpa gejala atau mengakibatkan gejala mirip flu seperti demam, batuk, dan kelelahan. Selain itu, dibandingkan dengan infeksi virus SARS-CoV dan influenza A, ciri khas infeksi SARS-CoV-2, COVID-19, adalah induksi yang buruk dari interferon tipe I (IFN). Khususnya, respons IFN yang terganggu dikaitkan dengan keparahan COVID-19. Namun, mekanisme molekuler yang mendasari tanggapan IFN yang tidak efisien pada infeksi SARS-CoV-2 masih belum jelas.

Dengan membandingkan urutan gen penyandi SARS-CoV-2 dengan yang ada pada SARS-CoV, kelompok peneliti menemukan bahwa panjang gen SARS-CoV-2 ORF3b secara nyata lebih pendek dibandingkan dengan SARS-CoV ORF3b.

Karena ORF3b dari SARS-CoV dikenal sebagai antagonis virus terhadap produksi IFN, mereka berhipotesis bahwa perbedaan panjang gen ORF3b antara SARS-CoV-2 dan SARS-CoV dapat mengubah aktivitas anti-IFN mereka dan selanjutnya dapat menjelaskan perbedaan tersebut. dalam gejala dua infeksi virus ini.

Anehnya, SARS-CoV-2 ORF3b adalah antagonis IFN yang lebih kuat daripada SARS-CoV ORF3b. Analisis filogenetik dan uji fungsional mengungkapkan bahwa virus terkait SARS-CoV-2 dari kelelawar dan trenggiling juga menyandikan produk gen ORF3b yang lebih pendek dengan aktivitas anti-IFN yang kuat.

Karakterisasi varian SARS-CoV-2 ORF3b alami dengan aktivitas anti-IFN yang ditingkatkan

Lebih lanjut, analisis sekitar 17.000 rangkaian SARS-CoV-2 mengidentifikasi varian alami, di mana kerangka pembacaan ORF3b yang lebih panjang disusun kembali. Varian ini menekan IFN bahkan lebih efisien daripada ORF3b strain SARS-CoV-2 induk.

Sesuai dengan hubungan antara penekanan IFN dengan tingkat keparahan penyakit, dua pasien di Ekuador yang menyimpan SARS-CoV-2 dengan varian ORF3b diperpanjang sakit kritis; satu dirawat di unit perawatan intensif dan yang lainnya meninggal karena COVID-19.

Yang penting, bagaimanapun, tidak ada bukti langsung yang menunjukkan bahwa virus yang terdeteksi pada dua pasien COVID-19 di Ekuador ini lebih patogen daripada strain referensi. Meskipun mereka tidak dapat mengatakan apakah varian ini terkait dengan hasil yang berbeda pada penyakit, masuk akal bahwa varian panjang ORF3b yang terjadi secara alami berpotensi berkontribusi pada munculnya varian SARS-CoV-2 yang lebih patogen.

Oleh karena itu, penting untuk terus memantau urutan virus untuk melihat apakah varian ORF3b baru muncul selama pandemi saat ini.

Associate Professor Kei Sato mengatakan bahwa “Sepengetahuan kami, penelitian ini adalah penyelidikan pertama yang mengungkap peran protein berkode SARS-CoV-2 yang dapat dikaitkan dengan perkembangan COVID-19.”

Untuk Informasi Lebih lanjut silahkan Kunjungi : Toto HK

Author Image
adminProzen