Investigasi multiomics mengungkapkan karakteristik sel yang terinfeksi HIV-1 secara in vivo – ScienceDaily

Investigasi multiomics mengungkapkan karakteristik sel yang terinfeksi HIV-1 secara in vivo – ScienceDaily


Untuk pemberantasan infeksi HIV-1, penting untuk menjelaskan fitur rinci dan heterogenitas sel yang terinfeksi HIV-1 secara in vivo. Dalam penelitian ini, model tikus manusia yang ditransplantasikan sel induk hematopoietik yang terinfeksi HIV-1 yang dimodifikasi gen digunakan untuk mengungkapkan beberapa karakteristik sel penghasil HIV-1 secara in vivo.

Sebuah kelompok penelitian di The Institute of Medical Science, The University of Tokyo (IMSUT) yang menggunakan sel yang terinfeksi HIV-1 melakukan analisis “multiomik”, yang merupakan teknologi yang baru-baru ini dikembangkan untuk menyelidiki fitur sampel biologis secara komprehensif.

“Penemuan kami menjelaskan beberapa karakteristik sel penghasil HIV-1 in vivo, yang dapat memberikan petunjuk untuk pengembangan obat HIV-1,” kata pemimpin ilmuwan, Kei Sato, Associate Professor (Principal Investigator) di Division of Sistem Virologi, Departemen Pengendalian Penyakit Menular, IMSUT.

Hasil penelitian ini dipublikasikan di Laporan Sel pada 14 Juli 2020.

Studi untuk “obat HIV-1”

Untuk pemberantasan infeksi HIV-1, penting untuk memperoleh pemahaman yang mendalam tentang berbagai karakteristik sel yang terinfeksi HIV-1 secara in vivo.

Analisis ‘omics’ (* 1) yang baru dikembangkan dapat menjadi alat yang ampuh untuk mengidentifikasi karakteristik sel yang terinfeksi HIV-1. Namun, perlu dicatat bahwa sebagian besar sel CD4 + T (* 2) pada orang yang terinfeksi tidak terinfeksi, dan oleh karena itu, profil transkripsi dari sel T CD4 + “massal” in vivo tidak mencerminkan yang dari HIV- “murni”. Sel penghasil 1.

Analisis multiomik untuk mengungkap secara komprehensif ciri-ciri sel yang terinfeksi HIV-1 secara in vivo

Dalam penelitian ini, kelompok penelitian menggunakan model tikus manusia yang ditransplantasikan sel induk hematopoietik manusia yang mempertahankan leukopoiesis manusia di bawah kondisi imunologi yang relatif stabil secara in vivo dan reporter yang kompeten untuk replikasi HIV-1, dan menggunakan empat teknik yang baru dikembangkan untuk menyelidiki genomik virus dan transcriptomics.

Menurut kelompok peneliti, penelitian ini terdiri dari empat analisis berikut:

Pertama, PCR digital droplet mengungkapkan adanya reservoir potensial pada tikus manusia yang terinfeksi. Kedua, PCR yang dimediasi ligasi menunjukkan preferensi HIV-1 untuk berintegrasi ke dalam daerah kromatin terbuka, seperti yang ditunjukkan oleh hubungan modifikasi epigenetik dari tempat integrasi dengan produksi virus. Ketiga, pengurutan RNA digital menghitung jumlah salinan absolut transkrip virus dalam sel penghasil HIV secara in vivo dan selanjutnya mengidentifikasi gen yang diekspresikan secara berbeda antara sel yang terinfeksi virus dan tidak terinfeksi. Akhirnya, pengurutan RNA sel tunggal mengungkapkan dan menandai heterogenitas sel penghasil HIV secara in vivo.

Associate Professor Sato menekankan “Sepengetahuan kami, penelitian ini adalah penelitian pertama yang menggambarkan berbagai aspek sel penghasil HIV dan juga penelitian komprehensif pertama tentang karakteristik sel yang terinfeksi HIV-1 secara in vivo”.

Catatan (* 1) analisis ‘omics’

Bidang studi ilmiah yang bertujuan untuk mengkarakterisasi dan mengukur fitur sampel biologis secara komprehensif. Kombinasi dari beberapa kategori informasi “-ome” biologis (misalnya, genom dan transkriptom).

(* 2) sel CD4 + T.

Bagian sel kekebalan yang mengatur respons imun yang didapat.

Pendanaan

Studi ini didukung sebagian oleh AMED J-PRIDE (19fm0208006h0003 to Kei Sato), KAKENHI Scientific Research B (18H02662 to Kei Sato), KAKENHI Scientific Research on Innovative Area “Neovirology” (16H06429, 16K21723, 17H05813, 19H04826) hingga Kei Sato , JST CREST (ke Kei Sato), JSPS KAKENHI PAGS 16H06279 (kepada K.Sato), Program Riset AMED tentang HIV / AIDS 19fk0410014 (19fk0410014, 19fk0410019 kepada Yoshio Koyanagi dan Kei Sato), dan JSPS Research Fellow (PD 19J01713 kepada Jumpei Ito1713 ).

Untuk Informasi Lebih lanjut silahkan Kunjungi : Joker123

Posted in STD
Author Image
adminProzen