Memanfaatkan data publik mengungkapkan informasi baru tentang perubahan genetik dan epigenetik serta perannya dalam kanker – ScienceDaily

Memanfaatkan data publik mengungkapkan informasi baru tentang perubahan genetik dan epigenetik serta perannya dalam kanker – ScienceDaily

[ad_1]

Sebuah studi baru, yang dipimpin oleh para peneliti dari University of California, Irvine, telah memperdalam pemahaman tentang mekanisme epigenetik dalam tumorigenesis dan mengungkapkan repertoar gen pendorong kanker yang sebelumnya tidak terdeteksi. Studi tersebut dipublikasikan minggu ini di Kemajuan Sains.

Menggunakan algoritme prediksi baru, yang disebut DORGE (Penemuan Onkogen dan gen suppressoR tumor menggunakan fitur Genetik dan Epigenetik), peneliti dapat mengidentifikasi gen penekan tumor baru (TSG) dan onkogen (OG), terutama yang memiliki mutasi langka, dengan mengintegrasikan koleksi data genetik dan epigenetik yang paling lengkap.

“Algoritma bioinformatika yang ada tidak cukup memanfaatkan fitur epigenetik untuk memprediksi gen pendorong kanker, terlepas dari fakta bahwa perubahan epigenetik diketahui terkait dengan gen pendorong kanker,” kata penulis senior Wei Li, PhD, ketua Grace B. Bell dan profesor bioinformatika di Departemen Kimia Biologi di Fakultas Kedokteran UCI. “Algoritme komputasi kami mengintegrasikan data publik pada epigenetik dan alternatif genetik, untuk meningkatkan prediksi gen pemicu kanker.”

Kanker terjadi akibat akumulasi perubahan genetik utama yang mengganggu keseimbangan antara pembelahan sel dan apoptosis. Gen dengan mutasi “pendorong” yang memengaruhi perkembangan kanker dikenal sebagai gen pendorong kanker, dan dapat diklasifikasikan sebagai TSG dan OG onkogen berdasarkan perannya dalam perkembangan kanker.

Studi ini mendemonstrasikan bagaimana gen pendorong kanker, yang diprediksi oleh DORGE, memasukkan baik gen pendorong kanker yang diketahui dan gen pendorong baru yang tidak dilaporkan dalam literatur saat ini. Selain itu, para peneliti menemukan bahwa gen fungsi ganda baru, yang diprediksi DORGE sebagai TSG dan OG, sangat diperkaya di pusat interaksi protein-protein (PPI) dan jaringan obat / senyawa-gen.

“Algoritme DORGE kami berhasil memanfaatkan data publik untuk menemukan perubahan genetik dan epigenetik yang memainkan peran penting dalam disregulasi gen penyebab kanker,” jelas Li. “Penemuan ini dapat menjadi instrumen dalam meningkatkan pencegahan kanker, diagnosis dan upaya pengobatan di masa depan.”

Sumber Cerita:

Materi disediakan oleh Universitas California – Irvine. Catatan: Konten dapat diedit gaya dan panjangnya.

Untuk Informasi Lebih lanjut silahkan Kunjungi : Data SGP

Author Image
adminProzen