Orgasme yang Segera Terjadi Pada Wanita Berhubungan Dengan Kaki Gelisah - ScienceDaily

Meningkatkan efisiensi pengurutan RNA sel tunggal membantu mengungkap perbedaan halus antara sel sehat dan disfungsional – ScienceDaily


Mengurutkan RNA dari sel-sel individu dapat mengungkapkan banyak informasi tentang apa yang dilakukan sel-sel itu di dalam tubuh. Peneliti MIT sekarang telah meningkatkan jumlah informasi yang dikumpulkan dari masing-masing sel tersebut, dengan memodifikasi teknik Seq-Well yang umum digunakan.

Dengan pendekatan baru mereka, tim MIT dapat mengekstrak 10 kali lebih banyak informasi dari setiap sel dalam sampel. Peningkatan ini seharusnya memungkinkan para ilmuwan untuk mempelajari lebih banyak tentang gen yang diekspresikan di setiap sel, dan membantu mereka untuk menemukan perbedaan halus namun penting antara sel yang sehat dan yang tidak berfungsi.

“Jelaslah bahwa teknologi ini memiliki potensi transformatif untuk memahami sistem biologis yang kompleks. Jika kita melihat berbagai kumpulan data yang berbeda, kita benar-benar dapat memahami lanskap kesehatan dan penyakit, dan itu dapat memberi kita informasi tentang strategi terapeutik apa yang mungkin kita lakukan. mempekerjakan, “kata Alex K. Shalek, seorang profesor kimia, anggota inti dari Institute for Medical Engineering and Science (IMES), dan anggota luar sekolah dari Koch Institute for Integrative Cancer Research di MIT. Dia juga anggota dari Ragon Institute of MGH, MIT dan Harvard dan anggota institut dari Broad Institute.

Dalam sebuah penelitian yang muncul minggu ini di Kekebalan, tim peneliti mendemonstrasikan kekuatan teknik ini dengan menganalisis sekitar 40.000 sel dari pasien dengan lima penyakit kulit yang berbeda. Analisis mereka terhadap sel kekebalan dan jenis sel lainnya mengungkapkan banyak perbedaan antara kelima penyakit, serta beberapa ciri umum.

“Ini sama sekali bukan ringkasan yang lengkap, tetapi ini adalah langkah pertama untuk memahami spektrum fenotipe inflamasi, tidak hanya di dalam sel kekebalan, tetapi juga dalam jenis sel kulit lainnya,” kata Travis Hughes, seorang mahasiswa MD / PhD di Harvard. Program -MIT dalam Ilmu dan Teknologi Kesehatan dan salah satu penulis utama makalah ini.

Shalek dan J. Christopher Love, Profesor Teknik Kimia Raymond A. dan Helen E. St. Laurent serta anggota Institut Koch dan Institut Ragon, adalah penulis senior studi ini. Mahasiswa pascasarjana MIT Marc Wadsworth dan mantan postdoc Todd Gierahn adalah penulis utama makalah ini bersama Hughes.

Menangkap kembali informasi

Beberapa tahun yang lalu, Shalek, Love, dan rekan mereka mengembangkan metode yang disebut Seq-Well, yang dapat dengan cepat mengurutkan RNA dari banyak sel tunggal sekaligus. Teknik ini, seperti pendekatan throughput tinggi lainnya, tidak mengambil banyak informasi per sel seperti beberapa metode yang lebih lambat dan lebih mahal untuk mengurutkan RNA. Dalam studi mereka saat ini, para peneliti berusaha menangkap kembali beberapa informasi yang hilang dari versi aslinya.

“Jika Anda benar-benar ingin menyelesaikan ciri-ciri yang membedakan penyakit, Anda memerlukan tingkat resolusi yang lebih tinggi daripada yang mungkin,” kata Love. “Jika Anda menganggap sel sebagai paket informasi, kemampuan mengukur informasi itu dengan lebih tepat memberikan wawasan yang jauh lebih baik tentang populasi sel apa yang mungkin ingin Anda targetkan untuk perawatan obat, atau, dari sudut pandang diagnostik, mana yang harus Anda pantau.”

Untuk mencoba memulihkan informasi tambahan itu, para peneliti memusatkan perhatian pada satu langkah di mana mereka tahu bahwa data sedang hilang. Pada langkah itu, molekul cDNA, yang merupakan salinan transkrip RNA dari setiap sel, diperkuat melalui proses yang disebut polymerase chain reaction (PCR). Amplifikasi ini diperlukan untuk mendapatkan salinan DNA yang cukup untuk sekuensing. Namun, tidak semua cDNA diperkuat. Untuk meningkatkan jumlah molekul yang berhasil melewati langkah ini, para peneliti mengubah cara mereka menandai cDNA dengan urutan “primer” kedua, sehingga memudahkan enzim PCR untuk memperkuat molekul-molekul ini.

Dengan menggunakan teknik ini, para peneliti menunjukkan bahwa mereka dapat menghasilkan lebih banyak informasi per sel. Mereka melihat peningkatan lima kali lipat dalam jumlah gen yang dapat dideteksi, dan peningkatan sepuluh kali lipat dalam jumlah transkrip RNA yang ditemukan per sel. Informasi tambahan tentang gen penting ini, seperti sitokin penyandi, reseptor yang ditemukan di permukaan sel, dan faktor transkripsi, memungkinkan para peneliti untuk mengidentifikasi perbedaan halus antar sel.

“Kami mampu sangat meningkatkan jumlah konten informasi per sel dengan trik biologi molekuler yang sangat sederhana, yang mudah untuk dimasukkan ke dalam alur kerja yang ada,” kata Hughes.

Tanda tangan penyakit

Dengan menggunakan teknik ini, para peneliti menganalisis 19 biopsi kulit pasien, yang mewakili lima penyakit kulit yang berbeda – psoriasis, jerawat, kusta, alopecia areata (penyakit autoimun yang menyebabkan kerontokan rambut), dan granuloma annulare (kelainan kulit degeneratif kronis). Mereka menemukan beberapa kesamaan antara kelainan – misalnya, populasi serupa dari sel T inflamasi tampak aktif pada kusta dan granuloma annulare.

Mereka juga menemukan beberapa ciri khas penyakit tertentu. Dalam sel dari beberapa pasien psoriasis, mereka menemukan bahwa sel yang disebut keratinosit mengekspresikan gen yang memungkinkan mereka berkembang biak dan mendorong peradangan yang terlihat pada penyakit itu.

Data yang dihasilkan dalam penelitian ini juga harus menawarkan sumber daya yang berharga bagi peneliti lain yang ingin mempelajari lebih dalam perbedaan biologis antara jenis sel yang diteliti.

“Anda tidak pernah tahu untuk apa Anda ingin menggunakan kumpulan data ini, tetapi ada peluang besar untuk mengukur semuanya,” kata Shalek. “Di masa depan, ketika kita perlu menggunakannya kembali dan memikirkan reseptor permukaan tertentu, ligan, protease, atau gen lain, kita akan memiliki semua informasi itu di ujung jari kita.”

Teknik ini juga dapat diterapkan pada banyak penyakit dan tipe sel lainnya, kata para peneliti. Mereka mulai menggunakannya untuk mempelajari kanker dan penyakit menular seperti tuberkulosis, malaria, HIV, dan Ebola, dan mereka juga menggunakannya untuk menganalisis sel kekebalan yang terlibat dalam alergi makanan. Mereka juga telah membuat teknik baru tersedia untuk peneliti lain yang ingin menggunakannya atau mengadaptasi pendekatan yang mendasari untuk studi sel tunggal mereka sendiri.

Penelitian ini didanai oleh Koch Institute Support (core) Grant dari National Institutes of Health, Bridge Project of the Koch Institute dan Dana-Farber / Harvard Cancer Center, Food Allergy Science Initiative di Broad Institute, the National Institutes. Kesehatan, Beckman Young Investigator Award, Sloan Research Fellowship in Chemistry, Pew-Stewart Scholar Award, dan Bill and Melinda Gates Foundation.

Untuk Informasi Lebih lanjut silahkan Kunjungi : Result SGP