Model komputer menggunakan ‘penampilan’ virus untuk memprediksi jenis flu musim dingin dengan lebih baik – ScienceDaily

Model komputer menggunakan ‘penampilan’ virus untuk memprediksi jenis flu musim dingin dengan lebih baik – ScienceDaily


Menggabungkan data genetik dan eksperimental ke dalam model tentang virus influenza dapat membantu memprediksi secara lebih akurat galur mana yang paling umum selama musim dingin mendatang, kata sebuah penelitian yang diterbitkan baru-baru ini di eLife.

Model tersebut dapat membuat desain vaksin flu lebih akurat, memberikan perlindungan yang lebih lengkap terhadap virus yang menyebabkan sekitar setengah juta kematian setiap tahun secara global.

Vaksin adalah perlindungan terbaik yang kita miliki terhadap flu. Tetapi virus mengubah penampilannya ke sistem kekebalan kita setiap tahun, mengharuskan para peneliti memperbarui vaksin agar sesuai. Karena pembuatan vaksin baru membutuhkan waktu hampir setahun, peneliti flu harus memprediksi virus flu mana yang paling mirip dengan virus di masa depan.

Cara standar emas untuk mempelajari influenza melibatkan eksperimen laboratorium yang mengamati molekul kunci yang melapisi virus yang disebut haemagglutinin. Tetapi metode ini padat karya dan membutuhkan waktu lama. Para peneliti telah berfokus pada penggunaan komputer untuk memprediksi bagaimana virus flu akan berevolusi dari urutan genetik haemagglutinin saja, tetapi data ini hanya memberikan sebagian gambaran.

“Komunitas penelitian influenza telah lama menyadari pentingnya mempertimbangkan karakteristik fisik virus flu, seperti bagaimana haemagglutinin berubah dari waktu ke waktu, serta informasi genetik,” jelas penulis utama John Huddleston, seorang mahasiswa PhD di Lab Bedford di Fred Hutchinson Cancer Research Center dan Molecular and Cell Biology Program di University of Washington, Seattle, AS. “Kami ingin melihat apakah menggabungkan model evolusi influenza hanya urutan genetik dengan pengukuran eksperimental berkualitas tinggi lainnya dapat meningkatkan perkiraan jenis flu baru yang akan muncul satu tahun ke depan.”

Huddleston dan tim melihat berbagai komponen ‘kebugaran’ virus – yaitu, seberapa besar kemungkinan virus berkembang dan terus berkembang. Ini termasuk seberapa mirip antigen virus dengan strain yang sebelumnya beredar (antigen menjadi komponen virus yang memicu respons imun). Mereka juga mengukur berapa banyak mutasi yang telah terkumpul oleh virus, dan apakah menguntungkan atau merugikan.

Menggunakan 25 tahun data flu historis, tim membuat prakiraan satu tahun ke depan dari semua musim flu yang tersedia. Setiap perkiraan memperkirakan seperti apa populasi virus di masa depan dengan menggunakan kode genetik virus, data percobaan, atau keduanya. Mereka membandingkan populasi flu yang diprediksi dan populasi nyata di masa depan untuk mengetahui tipe data mana yang lebih berguna untuk memprediksi evolusi virus.

Mereka menemukan bahwa prakiraan yang menggabungkan ukuran eksperimental penampilan virus dengan perubahan kode genetiknya lebih akurat daripada prakiraan yang hanya menggunakan kode genetik. Model paling informatif jika mereka menyertakan data eksperimental tentang bagaimana antigen flu berubah dari waktu ke waktu, adanya mutasi yang mungkin berbahaya, dan seberapa cepat populasi flu berkembang dalam enam bulan terakhir. “Urutan genetik saja tidak dapat secara akurat memprediksi jenis flu di masa depan – dan karena itu tidak boleh menggantikan eksperimen tradisional yang mengukur kemunculan virus,” kata Huddleston.

“Hasil kami menyoroti pentingnya pengukuran eksperimental untuk mengukur efek perubahan pada kode genetik virus dan memberikan dasar untuk upaya meramalkan sistem evolusi,” kata penulis senior Trevor Bedford, Peneliti Utama di Divisi Vaksin dan Penyakit Menular, Fred Hutchinson Pusat Penelitian Kanker, Seattle, Washington. “Kami berharap alat prakiraan sumber terbuka yang kami kembangkan dapat segera memberikan prakiraan yang lebih baik tentang populasi flu, yang mengarah pada peningkatan vaksin dan pada akhirnya lebih sedikit penyakit dan kematian akibat flu.”

Sumber Cerita:

Materi disediakan oleh eLife. Catatan: Konten dapat diedit untuk gaya dan panjangnya.

Untuk Informasi Lebih lanjut silahkan Kunjungi : Hongkong Prize

Posted in Flu
Author Image
adminProzen