Pendekatan analitis baru dapat berfungsi sebagai alat yang ampuh untuk mengevaluasi dan membandingkan perawatan – ScienceDaily

Pendekatan analitis baru dapat berfungsi sebagai alat yang ampuh untuk mengevaluasi dan membandingkan perawatan – ScienceDaily


Sebuah kerangka komputasi baru telah mengungkapkan perbedaan utama antara empat obat rheumatoid arthritis dan dampaknya pada jalur biologis pada tikus. Niki Karagianni dari Biomedcode Hellas SA, Yunani, dan rekan mempresentasikan pendekatan dan temuan baru mereka di Biologi Komputasi PLOS.

Orang dengan rheumatoid arthritis sering menerima obat yang menargetkan dan menghambat Tumor-Necrosis Factor (TNF), protein yang terlibat dalam karakteristik peradangan yang menyakitkan dan merusak dari penyakit tersebut. Sementara beberapa obat anti-TNF digunakan secara luas dengan keberhasilan klinis yang sebanding, rincian efek molekuler yang berbeda pada proses biologis masih belum jelas.

Untuk mengisi celah ini, Karagianni dan rekannya menggunakan model tikus poliartritis inflamasi kronis – tikus yang mengekspresikan TNF manusia dan mengembangkan gejala serta tanda tangan yang sangat mirip dengan bentuk penyakit pada manusia. Tikus yang sakit menerima pengobatan dengan salah satu dari empat obat anti-TNF (Remicade, Cimzia, Humira, atau Enbrel), atau sebagai pembanding, tidak ada obat. Para peneliti kemudian membandingkannya dengan tikus yang sehat.

Setelah perawatan, para peneliti mengumpulkan jaringan sendi dari semua tikus dan menganalisis transkriptom mereka – kumpulan lengkap molekul RNA pembawa pesan di jaringan, yang menunjukkan gen mana yang diaktifkan atau dinonaktifkan. Kemudian, mereka menerapkan serangkaian langkah komputasi pada data transkrip untuk membandingkan efek dari empat obat yang berbeda.

Analisis tersebut mengungkapkan perbedaan yang sebelumnya tidak diketahui dalam cara keempat obat tersebut mempengaruhi ekspresi gen pada tikus yang sakit. Beberapa dari perbedaan ini ditemukan untuk gen yang terlibat langsung dalam radang sendi, tetapi banyak ditemukan pada gen yang tidak terkait radang sendi, seperti gen yang terlibat dalam penyakit kardiovaskular dan kondisi lain yang mungkin terjadi bersamaan dengan radang sendi.

“Mungkin hasil terpenting dari penelitian kami adalah sejumlah besar gen yang diatur ke bawah pada hewan yang sakit, yang terkait dengan fungsi dan jalur yang sampai saat ini sebagian besar terabaikan,” kata rekan penulis studi Christoforos Nikolaou. “Ini bisa memberikan wawasan tambahan tentang mekanisme patologi arthritis.”

Kerangka kerja komputasi baru yang dikembangkan untuk penelitian ini dapat digunakan kembali untuk perbandingan rinci obat lain pada penyakit lain. Untuk membantu memfasilitasi ini, para peneliti bekerja untuk mengatur sistem menjadi paket mandiri otomatis.

Sumber Cerita:

Materi disediakan oleh PLOS. Catatan: Konten dapat diedit gaya dan panjangnya.

Untuk Informasi Lebih lanjut silahkan Kunjungi : Slot Online

Author Image
adminProzen