Penelitian genom bakteri merupakan tambahan yang berharga untuk diagnostik – ScienceDaily

Penelitian genom bakteri merupakan tambahan yang berharga untuk diagnostik – ScienceDaily


Pneumococcus (Streptococcus pneumoniae) merupakan penyebab penting pneumonia, sepsis, dan meningitis. Bakteri ini biasanya berada di rongga hidung. Biasanya, ini bukan masalah tetapi dapat membuat pasien yang lemah menjadi sangat sakit, seringkali dengan akibat yang fatal. Karakteristik pasien seperti usia, sistem kekebalan tubuh yang terganggu dan komorbiditas sebagian menjelaskan mengapa beberapa pasien mengalami pneumonia dan yang lainnya meningitis. Tidak diketahui apakah sifat pneumokokus itu sendiri juga menentukan bagaimana penyakit pneumokokus invasif memanifestasikan dirinya.

Variasi

Pneumococci menunjukkan variabilitas genetik yang sangat besar. Variasi ini sering dilambangkan dengan antibodi (serum) yang mengenali kapsul gula spesifik pada permukaan pneumokokus. Lebih dari sembilan puluh kapsul gula semacam itu (serotipe) dikenal. Meskipun ada hubungan antara serotipe ini dan perjalanan penyakit, variasi pneumokokus tidak terbatas pada perbedaan kapsul gula ini. Oleh karena itu, para peneliti di Radboudumc bekerja sama dengan RIVM, CWZ, Maasziekenhuis Pantein, Imperial College London dan Sanger Institute di Cambridge telah menentukan seluruh urutan DNA pneumokokus yang diisolasi dari darah 350 pasien. Mereka kemudian dapat menghubungkan variasi genetik yang mereka temukan dengan lebih dari dua puluh manifestasi penyakit.

Sawar darah otak

Para peneliti menemukan beberapa gen bakteri yang tampaknya terkait dengan jalannya infeksi. Kehadiran gen slaA, misalnya, tampaknya dapat memprediksi meningitis. Kode gen ini untuk protein fosfolipase A2. Penelitian sebelumnya menunjukkan bahwa protein ini terlibat dalam peradangan dan juga dapat mempengaruhi sawar darah-otak. Oleh karena itu, bakteri yang membawa gen ini dapat menembus otak. Seperangkat empat gen lainnya memprediksi apakah seorang pasien akan meninggal dalam 30 hari, terutama di antara mereka yang diperkirakan tidak akan meninggal pada pandangan pertama. Marien de Jonge, kepala bagian Penyakit Menular Anak di Radboudumc: “Sebelumnya kami menemukan bahwa salah satu kode gen ini untuk protein yang mengaktifkan trombosit darah, yang dapat menyebabkan pembekuan darah yang berlebihan dan peningkatan risiko kematian.” Gen yang diidentifikasi juga ditemukan pada kelompok kedua yang terdiri dari 500 pasien.

Tugas beresiko

Gen pneumokokus yang ditemukan juga dapat diukur dalam darah pasien. Ini memberikan peluang diagnostik, kata Amelieke Cremers, ahli mikrobiologi klinis dalam pelatihan dan penulis pertama artikel ini: “Studi ini menunjukkan bahwa teknik sekuensing DNA modern dapat digunakan untuk meningkatkan diagnosis penyakit menular. Pengetahuan tentang variasi genetik dalam spesies bakteri dapat meningkatkan penilaian risiko kami untuk pasien individu dengan infeksi akut. “

Sumber Cerita:

Materi disediakan oleh Pusat Medis Universitas Radboud. Catatan: Konten dapat diedit untuk gaya dan panjangnya.

Untuk Informasi Lebih lanjut silahkan Kunjungi : SGP Prize

Author Image
adminProzen