Platform AI eksperimental baru mencocokkan tumor dengan kombinasi obat terbaik – ScienceDaily

Platform AI eksperimental baru mencocokkan tumor dengan kombinasi obat terbaik – ScienceDaily


Hanya 4 persen dari semua obat terapeutik kanker yang sedang dikembangkan mendapatkan persetujuan akhir dari Food and Drug Administration (FDA) AS.

“Itu karena saat ini kami tidak dapat mencocokkan kombinasi obat yang tepat dengan pasien yang tepat dengan cara yang cerdas,” kata Trey Ideker, PhD, profesor di Fakultas Kedokteran Universitas California San Diego dan Pusat Kanker Moores. “Dan terutama untuk kanker, di mana kita tidak selalu bisa memprediksi obat mana yang akan bekerja paling baik mengingat cara kerja yang unik dan kompleks dari sel tumor seseorang.”

Dalam makalah yang diterbitkan pada 20 Oktober 2020 di Sel Kanker, Ideker dan Brent Kuenzi, PhD, dan Jisoo Park, PhD, peneliti postdoctoral di labnya, menjelaskan DrugCell, sistem kecerdasan buatan (AI) baru yang mereka ciptakan yang tidak hanya mencocokkan tumor dengan kombinasi obat terbaik, tetapi melakukannya dengan cara yang masuk akal bagi manusia.

“Kebanyakan sistem AI adalah ‘kotak hitam’ – mereka bisa sangat prediktif, tetapi kami sebenarnya tidak tahu banyak tentang cara kerjanya,” kata Ideker, yang juga co-direktur Cancer Cell Map Initiative dan the Sumber Daya Nasional untuk Biologi Jaringan.

Dia memberi contoh cara kerja pencarian gambar di internet untuk “kucing”. Sistem AI yang bekerja di belakang layar dilatih pada gambar kucing yang ada, tetapi bagaimana mereka sebenarnya memberi label gambar baru sebagai “kucing” dan bukan “tikus” atau sesuatu yang lain tidak diketahui.

Agar AI berguna dalam perawatan kesehatan, kata Ideker, kita harus dapat melihat ke dalam kotak hitam untuk memahami bagaimana sistem sampai pada kesimpulannya. “Kami perlu tahu mengapa keputusan itu dibuat, jalur apa yang menjadi target obat-obatan yang direkomendasikan itu dan alasan untuk respons obat yang positif atau untuk penolakannya.”

Pekerjaan tim pada DrugCell dimulai beberapa tahun lalu dalam ragi. Dalam studi sebelumnya, mereka membangun sistem AI yang disebut DCell menggunakan informasi tentang gen dan mutasi sel ragi. DCell memprediksi perilaku seluler, seperti pertumbuhan, semuanya berada di luar “kotak hitam”.

DrugCell, versi generasi berikutnya dari DCell, dilatih pada lebih dari 1.200 jalur sel tumor dan tanggapannya terhadap hampir 700 obat terapeutik eksperimental yang disetujui FDA – total lebih dari 500.000 jalur sel / pasangan obat. Para peneliti juga memvalidasi beberapa kesimpulan DrugCell dalam eksperimen laboratorium.

Dengan DrugCell, tim dapat memasukkan data tentang tumor dan sistem mengembalikan obat paling terkenal, jalur biologis yang mengontrol respons terhadap obat tersebut, dan kombinasi obat untuk mengobati keganasan dengan sebaik-baiknya.

Terapi kanker presisi sudah tersedia di Moores Cancer Center di UC San Diego Health, di mana pasien mungkin menjalani biopsi tumor mereka yang diurutkan untuk mutasi dan dinilai oleh Dewan Tumor Molekuler, sekelompok ahli interdisipliner. Dewan merekomendasikan terapi yang dipersonalisasi berdasarkan perubahan genom unik pasien dan informasi lainnya. Sebuah penelitian terbaru menunjukkan pasien ini memiliki hasil yang lebih baik. Di satu sisi, DrugCell mensimulasikan Dewan Tumor Molekuler manusia.

“Kami terkejut dengan seberapa baik DrugCell mampu menerjemahkan dari garis sel laboratorium, yang kami latih modelnya, ke tumor pada tikus dan pasien, serta data uji klinis,” kata Kuenzi.

Tujuan utama tim adalah memasukkan DrugCell ke klinik untuk kepentingan pasien, tetapi penulis penelitian mengingatkan bahwa masih banyak pekerjaan yang harus dilakukan.

“Meskipun 1.200 garis sel adalah permulaan yang baik, itu tentu saja tidak mewakili heterogenitas penuh kanker,” kata Park. “Tim kami sekarang menambahkan lebih banyak data sel tunggal dan mencoba struktur obat yang berbeda. Kami juga berharap dapat bermitra dengan studi klinis yang ada untuk menanamkan DrugCell sebagai alat diagnostik, mengujinya secara prospektif di dunia nyata.”

Untuk Informasi Lebih lanjut silahkan Kunjungi : Lagu Togel

Author Image
adminProzen