Protokol yang cepat dan andal menawarkan keuntungan berbeda dengan lebih sedikit tenaga kerja, keahlian, dan peralatan yang dibutuhkan – ScienceDaily

Protokol yang cepat dan andal menawarkan keuntungan berbeda dengan lebih sedikit tenaga kerja, keahlian, dan peralatan yang dibutuhkan – ScienceDaily


Untuk memantau dan membantu mengekang penyebaran COVID-19 dengan benar, beberapa juta tes diagnostik diperlukan setiap hari hanya di Amerika Serikat saja. Pengujian COVID-19 masih sangat kurang di AS dan banyak protokol diagnostik klinis memerlukan tenaga manusia yang ekstensif dan bahan-bahan yang dapat menghadapi kekurangan pasokan dan menimbulkan masalah keamanan hayati.

Standar emas saat ini untuk pengujian diagnostik COVID-19 di AS, yang dikembangkan oleh Pusat Pengendalian dan Pencegahan Penyakit (CDC) AS, adalah tes molekuler berbasis PCR (qPCR) kuantitatif yang mendeteksi keberadaan asam nukleat virus. Meskipun sangat akurat, tes yang disetujui CDC ini membutuhkan reagen khusus, peralatan, dan pelatihan personel. Selain itu, beberapa perangkat diagnostik yang telah dikembangkan dan diperkenalkan dengan cepat ke pasar memiliki batasan akurasi, biaya, dan distribusi. Selain itu, sistem pengujian yang saat ini digunakan tidak mudah diskalakan ke platform throughput tinggi untuk memberikan jutaan pengujian yang diperlukan per hari.

Mengingat kebutuhan mendesak untuk mengembangkan reagen dan pendekatan alternatif untuk menyediakan pengujian asam nukleat dalam menghadapi permintaan yang meningkat dan potensi kekurangan, tim peneliti dari Fakultas Kedokteran Schmidt Universitas Florida Atlantic telah mengembangkan protokol pengujian COVID-19 yang disederhanakan yang menawarkan perbedaan keunggulan dibandingkan virus standar atau media transpor universal (VTM). Protokol pengujian ini dapat mendeteksi SARS-CoV-2 dalam jumlah minimal menggunakan sampel dari penyeka saluran pernapasan bagian atas (hidung dan tenggorokan) serta air liur, dan dapat digunakan di laboratorium penelitian dengan peralatan dan keahlian biologi molekuler minimal.

Protokol, diterbitkan di PLOS ONE, memanfaatkan TRIzol (guanidinium tiosianat / fenol-kloroform) untuk memurnikan RNA virus dari berbagai jenis spesimen klinis, memerlukan kewaspadaan tingkat keamanan hayati minimal dan, mengingat sensitivitasnya yang tinggi, dapat dengan mudah disesuaikan dengan strategi pengumpulan sampel. Dengan menggunakan protokol yang disederhanakan ini, sampel dielusi dalam TRIzol segera setelah pengumpulan dan RNA diekstraksi. Hasil telah menunjukkan bahwa protokol ini seefisien, jika tidak lebih dari mikrokolom pemurnian RNA berbasis membran silika yang disetujui CDC dalam mengisolasi sejumlah kecil RNA virus dan seluler dari berbagai jenis sampel (usap hidung dan tenggorokan serta air liur).

“Sensitivitas tinggi dari protokol kami mungkin berguna dalam menguji pasien dengan titer virus rendah seperti pasien tanpa gejala atau menguji individu sebelum pelepasan karantina. Metode kami juga memungkinkan beberapa sampel pasien untuk dikumpulkan, mengurangi jumlah tes yang diperlukan untuk populasi yang lebih besar, “kata Massimo Caputi, Ph.D., penulis utama dan profesor ilmu biomedis di Fakultas Kedokteran Schmidt FAU. “Selain itu, pengujian dapat dengan mudah dilakukan oleh setiap laboratorium penelitian yang dilengkapi dengan peralatan standar minimal. Karena air liur dapat digunakan sebagai sumber virus yang andal, sampel dapat diperoleh sendiri oleh pasien dan dinonaktifkan di TRIzol, sehingga tidak memerlukan perawatan medis. staf dan protokol dan fasilitas biosafety tingkat yang lebih tinggi. “

Dengan pendekatan baru ini, sampel terlebih dahulu dikumpulkan dan diuji; pool positif kemudian diuji ulang secara individual. Solusi yang relatif sederhana ini mengurangi sumber pengujian yang digunakan tetapi mengakibatkan hilangnya kepekaan dari pengenceran sampel pasien positif dengan sampel negatif, oleh karena itu diperlukan pengujian yang sangat sensitif yang memanfaatkan bahan biologis, seperti air liur, yang dapat diperoleh dalam jumlah yang lebih banyak dan dapat mudah disimpan untuk pengujian ulang.

Protokol ini menggunakan reagen kimia umum yang banyak tersedia dan dapat mengisolasi RNA berkualitas tinggi yang dapat digunakan untuk berbagai pengujian dan proyek pengurutan RNA. Selain itu, sampel dalam TRIzol dapat disimpan pada suhu 4 C selama lebih dari seminggu dengan degradasi minimal dan sedikit atau tidak ada kehilangan RNA virus. Selain itu, kemampuan untuk menggunakan sampel air liur, yang lebih sensitif dan dapat diandalkan daripada usap nasofaring, menawarkan alternatif spesimen yang menarik. Usap hidung dan tenggorokan adalah spesimen saluran pernapasan bagian atas yang paling umum digunakan untuk pengujian diagnostik COVID-19. Namun, pengumpulan jenis spesimen ini dapat menyebabkan ketidaknyamanan, pendarahan, dan memerlukan kontak dekat antara petugas kesehatan dan pasien, sehingga menimbulkan risiko penularan.

Dalam protokol pengujian COVID-19 yang paling umum digunakan, penyedia layanan kesehatan mengumpulkan usap hidung atau tenggorokan dan mentransfernya ke botol berisi beberapa mililiter VTM. Sampel kemudian diangkut ke laboratorium untuk diuji. Pengangkutan dan penyimpanan dapat memakan waktu dari beberapa jam hingga beberapa hari tergantung pada jarak dan waktu pemrosesan dari laboratorium klinis terdekat. CDC merekomendasikan bahwa spesimen disimpan pada suhu 2 hingga 8 C hingga 72 jam setelah pengumpulan dan pada -70 C atau lebih rendah untuk periode waktu yang lebih lama. Namun, logistik yang memiliki beberapa titik pengumpulan sampel, chokeholds dalam rantai pasokan reagen, dan peningkatan permintaan yang tiba-tiba untuk pengujian karena wabah lokal dapat menghasilkan penundaan yang tidak terduga dalam pemrosesan sampel.

“Kami dapat mengharapkan permintaan yang tinggi untuk pengujian COVID-19 di masa mendatang karena pengujian pada populasi umum dan individu tanpa gejala menjadi lebih luas,” kata Janet Robishaw, Ph.D., rekan penulis, dekan senior untuk penelitian dan ketua. dari Departemen Ilmu Biomedis di Fakultas Kedokteran Schmidt FAU. “Kurangnya pengendalian pandemi di banyak negara terbelakang serta berlanjutnya eskalasi COVID-19 di AS juga menjadi alasan kuat untuk meningkatkan upaya pengujian. Kami berharap kombinasi pendekatan pengujian, termasuk protokol seperti milik kami, dapat menjadi cara paling efisien untuk mengisi celah saat ini dan masa depan dalam pengujian. “

Rekan penulis studi adalah Sean Paz; Christopher Mauer; dan Anastasia Richtie; mahasiswa pascasarjana di Fakultas Kedokteran Schmidt FAU.

Pekerjaan ini didukung oleh dana yayasan Florida Blue, “Mengembangkan Algoritma Prediktif untuk Infeksi COVID-19 pada Pekerja Perawatan Kesehatan FAU.”

Sumber Cerita:

Materi disediakan oleh Universitas Atlantik Florida. Asli ditulis oleh Gisele Galoustian. Catatan: Konten dapat diedit gaya dan panjangnya.

Untuk Informasi Lebih lanjut silahkan Kunjungi : Lagu Togel

Author Image
adminProzen