Seorang penjaga transkriptom manusia – ScienceDaily

Seorang penjaga transkriptom manusia – ScienceDaily


Dalam kolaborasi bersama, peneliti Denmark dan Jerman telah menandai aktivitas seluler yang melindungi sel kita dari produk sampingan yang berpotensi beracun dari ekspresi gen. Aktivitas ini penting bagi kemampuan organisme multisel untuk mempertahankan ‘reservoir’ produk gen evolusioner yang kuat.

Proses manufaktur membutuhkan sistem kontrol kualitas untuk memastikan perakitan produk fungsional yang tepat. Selain itu, produk sampingan yang memakan ruang, dan bahkan mungkin beracun, dari proses semacam itu perlu dibuang atau didaur ulang dengan benar oleh sistem penanganan limbah yang efisien.

Dengan analogi, transkripsi genom kita adalah proses tidak sempurna yang menghasilkan sejumlah besar transkrip non-fungsional dan berpotensi berbahaya baik dari dalam maupun luar gen konvensional. Enzim RNA polimerase II mentranskripsikan sebagian besar gen kita, dan juga menghasilkan transkrip pervasif dari beberapa daerah non-genik. Selama dekade terakhir, semakin jelas bahwa enzim ini relatif tidak pilih-pilih ketika sampai pada tempat dimulainya, dan ada situs inisiasi transkripsi yang tersebar di mana-mana dalam genom. Namun, tidak semua situs ini dikaitkan dengan gen yang ‘tepat’, dan ini membutuhkan keberadaan elemen khusus yang menentukan gen.

Penemuan aktivitas baru protein kompleks ‘Integrator’

Dalam artikel baru yang diterbitkan di jurnal internasional Sel Molekuler, sebuah tim peneliti Denmark-Jerman kini telah menunjukkan bahwa ‘Integrator’ kompleks multi-protein – yang sebelumnya digambarkan sebagai faktor penghentian transkripsi untuk kelas gen tertentu yang mengkode RNA nuklir kecil (sn) – sebenarnya adalah default ‘ faktor terminasi dini untuk sebagian besar, jika tidak semua kejadian inisiasi RNA polimerase II.

Transkrip pendek yang dihasilkan dalam banyak kasus terdegradasi dengan cepat oleh eksosom RNA ribonukleolitik. Mekanisme ini juga berperan dalam berbagai tingkat di dalam gen konvensional, tetapi ini telah mengembangkan elemen, melawan penghentian dini seperti itu, untuk memfasilitasi perpanjangan transkripsi yang produktif, yang pada akhirnya menghasilkan transkrip fungsional seperti RNA ‘pembawa pesan’ (m) pengkode protein.

Melalui mekanisme tindakan yang baru ditemukan ini, Integrator memastikan bahwa produksi transkrip yang tidak berguna tetap terbatas, sementara pada saat yang sama memungkinkan pemeliharaan ribuan situs awal transkripsi di bawah seleksi netral dalam genom manusia. Ini menyediakan reservoir unit transkripsi yang dapat berubah menjadi gen fungsional dari waktu ke waktu, dicontohkan oleh evolusi RNA fungsional genom kita yang saat ini dikenal. Sebagai contoh aneh, gen snRNA tampaknya menjadi kasus khusus, mengambil keuntungan dari aktivitas penghentian awal umum Integrator dan menangkis aktivitas RNA eksosom berikutnya untuk memungkinkan produksi RNA fungsional yang stabil.

Mutasi yang tidak aktif dalam subunit Integrator menyebabkan gangguan perkembangan saraf yang parah, dan peningkatan ekspresi beberapa subunit integrator dikaitkan dengan peningkatan transisi epitelial ke mesenkim – langkah kunci dalam metastasis tumor. Dualitas ini menyoroti perlunya kontrol ketat atas aktivitas Integrator. Selain itu, kesadaran bahwa Integrator adalah peredam umum transkripsi nonproduktif dapat menginformasikan karakterisasi molekuler dan pengobatan potensial dari penyakit tersebut.

Sumber Cerita:

Materi disediakan oleh Universitas Aarhus. Asli ditulis oleh Lisbeth Heilesen. Catatan: Konten dapat diedit gaya dan panjangnya.

Untuk Informasi Lebih lanjut silahkan Kunjungi : Lagu Togel

Author Image
adminProzen