Tes ‘Metagenomic’ untuk infeksi neurologis memiliki manfaat klinis yang nyata – ScienceDaily

Tes ‘Metagenomic’ untuk infeksi neurologis memiliki manfaat klinis yang nyata – ScienceDaily


Dalam analisis dampak dunia nyata dari tes perintis yang disebut metagenomic next-generation sequencing (mNGS), yang dikembangkan oleh ilmuwan UCSF untuk mendiagnosis pasien dengan kondisi neurologis inflamasi misterius, teknik ini terbukti mengidentifikasi infeksi lebih baik daripada metode klinis standar.

“Penyebab infeksi dari setengah kasus meningitis dan ensefalitis tidak terdiagnosis di rumah sakit di seluruh negeri, dan pasien yang sakit parah ini sangat membutuhkan alat pengujian yang lebih baik,” kata Charles Chiu, MD, PhD, profesor kedokteran dan kedokteran laboratorium. di UCSF dan penulis senior studi baru ini. Tidak seperti pengujian konvensional, yang sering didorong oleh firasat dokter, tes mNGS menawarkan pendekatan yang tidak bias yang dapat mendeteksi hampir semua kemungkinan patogen – bakteri, virus, jamur dan parasit – yang ada dalam cairan tulang belakang pasien, memberikan arahan yang jelas kepada dokter. pengobatan.

Studi yang dipublikasikan 13 Juni 2019 di Jurnal Kedokteran New England, didirikan untuk hanya mendaftarkan kasus yang paling menantang. Untuk memenuhi syarat, seorang pasien harus dirawat di rumah sakit karena penyakit saraf akut tanpa diagnosis yang pasti. Penelitian ini melibatkan 204 pasien anak dan dewasa, kebanyakan dari California, yang menderita meningitis (radang selaput yang mengelilingi otak), ensefalitis (radang otak itu sendiri) atau mielitis (radang sumsum tulang belakang).

Tes tersebut menemukan banyak infeksi yang sama yang diidentifikasi oleh metode pengujian laboratorium konvensional, yang umumnya mencari patogen satu per satu, dan mengharuskan dokter mengetahui apa yang mereka cari agar berhasil. Tetapi juga ditemukan 13 infeksi yang terlewat oleh semua tes konvensional, seperti kasus infeksi virus ensefalitis St. Louis, yang tidak pernah terlihat di California sejak 1986. Dan di lebih dari separuh kasus tersebut, diagnosis mNGS adalah sangat diperlukan dalam memandu pengobatan pasien ini. Dalam kasus infeksi virus hepatitis E yang terlewat oleh pengujian konvensional, diagnosis mNGS yang berhasil kemungkinan besar menghindarkan pasien dari keharusan menjalani transplantasi hati.

“Tes mNGS umumnya dipesan sebagai tes pilihan terakhir, dan kami akhirnya mendaftarkan pasien yang paling sulit untuk didiagnosis,” kata Chiu, yang juga direktur Pusat Diagnostik dan Penemuan Virus UCSF-Abbott. “Semua tes mikrobiologi konvensional menggabungkan hasil diagnosis pada kurang dari 50 persen dari pasien ini. Kami telah menunjukkan bahwa satu tes – mNGS – dapat membuat perubahan signifikan pada angka itu.”

Secara keseluruhan, tes tersebut mengidentifikasi 32 infeksi sistem saraf pada 31 pasien. Selain 13 diagnosis yang dibuat oleh mNGS saja, teknologi baru tersebut mengkonfirmasi 19 infeksi yang juga telah didiagnosis dengan tes konvensional.

Kurang dari separuh kasus meningitis dan ensefalitis disebabkan oleh infeksi. Sebagian besar sisanya adalah akibat reaksi autoimun, di mana tubuh pasien menyerang sistem saraf. Kedua kondisi tersebut memerlukan perawatan yang sangat berbeda, namun – menekan kekebalan pada pasien dengan infeksi dapat berbahaya, dan pemberian antibiotik dalam kasus penyakit autoimun tidak efektif dan mungkin tidak perlu meningkatkan resistensi antimikroba – jadi hal pertama yang perlu dilakukan dokter ketahui saat merawat pasien tersebut adalah kategori penyakit inflamasi yang mereka miliki.

“Pasien dengan ensefalitis menular dan tidak menular secara klinis tidak dapat dibedakan satu sama lain,” kata Michael Wilson, MD, profesor neurologi di UCSF dan salah satu penulis makalah, bersama dengan koordinator studi Hannah Sample. “Memiliki tes berbasis luas yang mengatur infeksi atau mengesampingkan infeksi benar-benar dapat membantu kasus yang berada di area abu-abu antara infeksi dan tidak.”

Namun, tes baru ini tidak sempurna, dan ada 26 infeksi yang tidak dapat didiagnosis. Pada sebagian besar kasus ini, DNA dari patogen tidak ada dalam cairan tulang belakang, memerlukan analisis jenis sampel yang berbeda, seperti jaringan dari abses otak, atau penggunaan metode pengujian tidak langsung, seperti pengujian antibodi, untuk membuatnya. diagnosa. Contoh dalam penelitian tersebut adalah infeksi virus West Nile, yang seringkali tidak dapat diidentifikasi dengan mengurutkan materi genetik virus yang terdapat dalam cairan tulang belakang karena cepat sekali datang dan pergi.

Dalam beberapa kasus, mNGS menemukan petunjuk infeksi seperti tuberkulosis yang meninggalkan sedikit jejak di cairan tulang belakang. Tetapi meskipun infeksi ini tidak terdeteksi pada tingkat yang cukup tinggi untuk dilaporkan secara pasti, mengetahui bahwa mereka ada, bahkan dalam jumlah kecil, masih dapat membantu dokter dengan mengarahkan mereka untuk memesan tes diagnostik lain untuk memastikan apakah patogen itu ada.

Untuk Informasi Lebih lanjut silahkan Kunjungi : Slot Online

Author Image
adminProzen