Tes patologi standar mengungguli subtipe molekuler pada kanker kandung kemih – ScienceDaily

Tes patologi standar mengungguli subtipe molekuler pada kanker kandung kemih – ScienceDaily


Saat mencoba mengembangkan cara yang relatif mudah dan murah untuk memberi dokter dan pasien kanker kandung kemih ide yang lebih baik tentang kemungkinan hasil dan pilihan pengobatan terbaik, para ilmuwan menemukan bahwa teknik subtipe baru yang canggih yang dirancang untuk melakukan hal ini tidak memberikan informasi yang lebih baik daripada patologi yang telah berlangsung lama. tes.

Mereka melihat beberapa set data pada spesimen kanker dari pasien dengan kanker kandung kemih invasif otot, kanker tingkat tinggi yang terkait dengan tingkat kematian yang tinggi. Kumpulan data termasuk yang digunakan untuk menentukan subtipe molekuler yang muncul, dan memiliki informasi hasil pada pasien.

Mereka secara konsisten menemukan bahwa subtipe molekuler tumor kandung kemih, yang saat ini ditawarkan kepada pasien, mengungguli tes standar yang telah lama digunakan oleh ahli patologi untuk mengkarakterisasi kanker sebagai kanker tingkat rendah atau tinggi dan untuk menentukan sejauh mana invasi ke dinding kandung kemih. , lemak di sekitar, kelenjar getah bening, pembuluh darah, dan lainnya, mereka melaporkan dalam sebuah penelitian yang ditampilkan di sampul Jurnal Urologi.

“Kanker kandung kemih invasif otot bersifat agresif, seringkali memiliki prognosis yang sangat buruk,” kata Dr. Vinata B. Lokeshwar, ketua Departemen Biokimia dan Biologi Molekuler di Medical College of Georgia di Universitas Augusta. “Setiap orang berusaha mencari tahu bagaimana meningkatkan diagnosis, pengobatan, dan kelangsungan hidup.”

“Profil genetik tumor pasien pasti memiliki nilai dalam memungkinkan Anda menemukan pendorong pertumbuhan dan metastasis yang membantu mengarahkan pengobatan individu tersebut, bahkan saat membantu mengidentifikasi target pengobatan baru,” kata Lokeshwar, penulis studi terkait dan anggota dari Pusat Kanker Georgia. “Tetapi menggunakan informasi ini untuk subtipe tumor tampaknya tidak menambah nilai diagnostik atau prognostik untuk pasien.”

Sebaliknya para peneliti menyarankan bahwa lebih banyak penelitian diperlukan sebelum subtipe molekuler digunakan untuk membantu memandu perawatan pasien.

Pendekatan diagnostik yang berkembang termasuk mengumpulkan bank data tentang ekspresi gen dan mutasi yang ada pada jenis kanker untuk menemukan pola ekspresi gen yang kemudian digunakan untuk tumor subtipe yang “secara patologis terlihat serupa” tetapi berbeda secara molekuler. Idenya adalah bahwa subtipe molekuler lebih siap untuk menunjukkan kanker mana yang lebih atau kurang agresif dan untuk membantu mengarahkan pilihan pengobatan seperti apakah kemoterapi sebelum operasi untuk mengangkat kandung kemih yang sakit lebih baik.

Itu adalah sekuensing RNA, atau RNA-Seq, dan bank data federal materi genetik dari berbagai macam kanker yang memungkinkan para peneliti dari seluruh dunia untuk memeriksa ekspresi gen dalam jenis tumor tertentu, mencari ekspresi umum dari beberapa gen yang berkorelasi dengan hasil klinis tertentu. Dua subtipe, luminal, yang memprediksi kelangsungan hidup lebih baik, dan basal, yang memprediksi prognosis buruk, pertama kali diidentifikasi untuk kanker kandung kemih invasif otot, dan total enam subtipe sekarang telah muncul. Makalah pertama tentang subtipe kanker kandung kemih invasif otot diterbitkan dalam jurnal Nature pada tahun 2014.

Tetapi dalam pencarian mereka untuk menemukan tes yang lebih sederhana, lebih murah, dan tersedia secara luas untuk memberikan wawasan serupa, para peneliti menemukan bahwa subtipe yang muncul ini mengungguli parameter klinis biasa seperti tingkat tumor dan penyebarannya ke kelenjar getah bening atau pembuluh darah, kata Lokeshwar.

Pekerjaan mereka dimulai dengan tinjauan mendalam oleh mahasiswa pascasarjana Daley S. Morera dan Sarrah S. Lahorewala dari kumpulan data pasien dan metode klasifikasi berbeda yang digunakan untuk mengidentifikasi subtipe molekuler.

Mereka menemukan 11 gen yang umum di semua metode klasifikasi subtipe. Mereka berpikir, jika mereka akan mengembangkan tes yang tersedia secara luas, subtipe berdasarkan gen umum ini mungkin cukup. Mereka memutuskan untuk memanggil panel subtipe baru mereka, MCG-1.

Alih-alih melakukan RNA-Seq, yang harganya beberapa ribu dolar, mereka menggunakan metode PCR kuantitatif transkripsi terbalik yang tersedia seharga kurang dari $ 10, yang juga melihat ekspresi gen dan sebenarnya digunakan untuk memverifikasi data RNA-Seq, kata Lokeshwar.

Mereka pertama kali melihat kohort mereka sendiri dari 52 pasien dengan kanker kandung kemih, 39 di antaranya memiliki penyakit invasif otot. Mereka menemukan MCG-1 hanya akurat 31-36% dalam memprediksi indikator penting seperti kemungkinan metastasis; penyakit kelangsungan hidup khusus, yang berarti selamat dari kanker kandung kemih; atau kelangsungan hidup secara keseluruhan, yang berarti kelangsungan hidup dari semua penyebab kematian dari saat diagnosis kanker atau awal pengobatan sampai penelitian selesai.

Menyadari bahwa kumpulan data yang mereka gunakan relatif kecil dan bahwa mereka tidak menggunakan RNA-Seq untuk analisis, mereka kemudian menggunakan tiga kumpulan data pasien dari database kanker ONCOMINE yang memiliki lebih banyak pasien – 151 dengan kanker kandung kemih invasif otot – dan juga menggunakan RNA -Seq untuk melihat ekspresi gen.

“Kami menemukan hal yang sama: MCG-1 tidak dapat memprediksi kematian khusus penyakit,” kata Lokeshwar. Pada beberapa pasien dalam kumpulan data ini, informasi tentang respons terhadap kemoterapi, seperti kemoterapi berbasis cisplatin yang umum digunakan setelah operasi pengangkatan kandung kemih, tersedia tetapi subtipe juga tidak dapat memprediksi respons kemoterapi, katanya.

Selanjutnya mereka melihat kumpulan data yang telah digunakan oleh jaringan peneliti yang besar untuk mengidentifikasi subtipe, The Cancer Genome Atlas, atau TCGA. TCGA adalah proyek dari Institut Kanker Nasional dan Institut Penelitian Genom Manusia Nasional yang dimulai pada tahun 2006, dan telah mengumpulkan materi genetik untuk 33 jenis kanker yang berbeda. Dataset tersebut mencakup informasi patologi rutin pada 402 spesimen dari pasien dengan kanker kandung kemih invasif otot. Ini juga mencakup kelangsungan hidup pasien secara keseluruhan dan kelangsungan hidup bebas kekambuhan – yaitu ketika atau jika kanker mereka kembali atau berkembang.

“Sampai saat ini, kami telah mengamati pasien yang tidak dilihat kelompok lain,” kata Lahorewala.

Dalam kumpulan data ini MCG-1 memprediksi kelangsungan hidup secara keseluruhan yang mirip dengan temuan yang dilaporkan dari subtipe dalam beberapa publikasi terkenal.

“Kami tertarik mengapa MCG-1 tidak dapat memprediksi apa pun dalam kelompok kami atau kumpulan data ONCOMINE tetapi memprediksi kelangsungan hidup secara keseluruhan dalam kumpulan data TCGA,” kata Morera.

Jadi mereka melihat lagi pada 402 pasien yang spesimennya ada dalam kumpulan data dan menemukan bahwa 21 tumor pasien sebenarnya tingkat rendah. Pasien dengan tumor tingkat rendah memiliki survivabilitas yang lebih tinggi dan prognosis yang lebih baik daripada pasien dengan penyakit invasif otot tingkat tinggi.

Ketika mereka menghapus kasus tingkat rendah dari kumpulan data TCGA, MCG-1 secara akurat tidak memprediksi apa-apa, bahkan kelangsungan hidup secara keseluruhan. Kemudian mereka memasukkan beberapa pasien dengan tumor tingkat rendah ke dalam kumpulan data mereka sendiri, yang mereka lihat pada awalnya, dan MCG-1 sekarang dapat memprediksi metastasis dan kelangsungan hidup penyakit tertentu, kata para peneliti.

Semua subtipe yang ada dikategorikan sebagai buruk atau lebih baik berdasarkan prognosis kanker, kata para peneliti. Kehadiran tumor tingkat rendah dalam klasifikasi subtipe mengubah data sehingga tampak seperti subtipe yang memprediksi kelangsungan hidup secara keseluruhan, padahal tingkat kanker itu sendiri yang bersifat prediktif.

“Sebagai penyelidik, hal pertama yang kami lakukan adalah mempertanyakan temuan kami, karena hasilnya sangat berbeda dari yang dilaporkan oleh orang lain,” kata Lokeshwar.

Dengan bantuan ahli biostatistik MCG dan rekan penulis Dr. Santu Ghosh, mereka juga kembali dan melihat pasien yang sama dalam kumpulan data TCGA dan subtipe yang telah mereka tetapkan dengan tiga metode klasifikasi berbeda yang dibuat oleh jaringan peneliti kanker kandung kemih.

“Bahkan dengan metode klasifikasi yang sudah mapan ini, subtipe hanya akurat sekitar 50% dari waktu dalam memprediksi kelangsungan hidup pasien secara keseluruhan. Dan sekali lagi, parameter patologi rutin seperti invasi ke kelenjar getah bening atau pembuluh darah lebih akurat daripada subtipe yang ditetapkan dalam memprediksi prognosis pasien, “kata Lahorewala.

Studi terbaru oleh para peneliti di Universitas Lund Swedia yang diterbitkan dalam jurnal Urologic Oncology mendukung temuan para peneliti MCG. Studi mereka terhadap 519 pasien yang kandung kemihnya diangkat karena kanker kandung kemih menemukan subtipe tidak terkait dengan kelangsungan hidup spesifik kanker.

Bagian dari masalah subtipe mungkin karena heterogenitas tumor yang melekat, kata Morera. Ada heterogenitas yang luar biasa dalam ekspresi gen tumor, bahkan di antara jenis tumor yang sama, seperti kanker kandung kemih, dan dalam berbagai bagian tumor yang sama juga. Lebih lanjut, pola heterogenitas ini dapat berubah selama pertumbuhan tumor dan pengobatan.

“Hanya karena itu kanker kandung kemih tidak berarti sama pada semua pasien. Kami tahu bahwa tumor sangat dinamis sehingga ada heterogenitas,” kata Lokeshwar.

“Karena ada heterogenitas, mungkin ada masalah saat Anda ingin mengkategorikan tumor ke dalam satu subtipe,” kata Morera.

Seperti namanya, kanker kandung kemih invasif otot telah menyebar dari lapisan organ mirip kantung ke dinding ototnya. Tumor derajat tinggi, jika tidak terdeteksi dini, akan menyebar ke otot kandung kemih, sedangkan tumor derajat rendah jarang bersifat invasif. Darah tanpa rasa sakit dalam urin adalah tanda paling umum dari kanker kandung kemih meskipun hanya sebagian kecil orang yang mengidap kanker itu. Merokok merupakan faktor risiko utama kanker kandung kemih.

Penelitian yang dipublikasikan didukung oleh National Cancer Institute dan Program Penelitian Kanker yang Ditinjau Sejawat dari Departemen Pertahanan.

Untuk Informasi Lebih lanjut silahkan Kunjungi : Keluaran HK

Author Image
adminProzen