Virus dengan perubahan D614G di Spike mengalahkan strain asli, tetapi mungkin tidak membuat pasien lebih sakit – ScienceDaily

Virus dengan perubahan D614G di Spike mengalahkan strain asli, tetapi mungkin tidak membuat pasien lebih sakit – ScienceDaily

[ad_1]

Riset hari ini di jurnal Sel menunjukkan bahwa perubahan spesifik pada genom virus coronavirus SARS-CoV-2, yang sebelumnya terkait dengan peningkatan penularan virus dan penyebaran COVID-19, lebih menular dalam kultur sel. Varian yang dimaksud, D614G, membuat perubahan kecil tapi efektif pada protein ‘Spike’ virus, yang digunakan virus untuk memasuki sel manusia.

Bette Korber, ahli biologi teoritis di Los Alamos National Laboratory dan penulis utama studi tersebut, mencatat, “Varian D614G pertama kali menjadi perhatian kami pada awal April, karena kami telah mengamati pola repetitif yang mencolok. Di seluruh dunia, bahkan saat lokal epidemi memiliki banyak kasus dari bentuk aslinya yang beredar, segera setelah varian D614G diperkenalkan ke suatu wilayah, itu menjadi bentuk yang umum. “

Informasi geografis dari sampel dari database urutan virus GISAID COVID-19 memungkinkan pelacakan pola yang sangat berulang ini, perubahan dalam populasi virus dari bentuk asli ke varian D614G. Ini terjadi di setiap tingkat geografis: negara, subnegara, kabupaten, dan kota.

Dua baris independen bukti eksperimental yang mendukung hasil awal ini disertakan dalam makalah hari ini. Eksperimen tambahan ini, yang dipimpin oleh Profesor Erica Ollmann Saphire, Ph.D., di La Jolla Institute, dan oleh Profesor David Montefiori, Ph.D., di Universitas Duke, menunjukkan bahwa perubahan D614G meningkatkan infektivitas virus di laboratorium. Percobaan baru ini, serta urutan yang lebih luas dan data klinis serta model statistik yang ditingkatkan, disajikan di Sel kertas. Lebih banyak pekerjaan in vivo masih harus dilakukan untuk menentukan implikasi penuh dari perubahan tersebut.

Virus SARS-CoV-2 memiliki tingkat mutasi yang rendah secara keseluruhan (jauh lebih rendah daripada virus yang menyebabkan influenza dan HIV-AIDS). Varian D614G muncul sebagai bagian dari serangkaian empat mutasi terkait yang tampaknya muncul satu kali dan kemudian berpindah bersama di seluruh dunia sebagai rangkaian variasi yang konsisten.

“Ini luar biasa bagi saya,” komentar Will Fischer dari Los Alamos, seorang penulis studi tersebut, “baik bahwa peningkatan infektivitas ini dideteksi dengan pengamatan yang cermat terhadap data sekuens saja, dan bahwa rekan eksperimental kami dapat mengonfirmasinya dengan virus hidup di dalamnya. waktu yang singkat. “

Untungnya, “data klinis dalam makalah ini dari Sheffield menunjukkan bahwa meskipun pasien dengan virus G baru membawa lebih banyak salinan virus daripada pasien yang terinfeksi D, tidak ada peningkatan yang sesuai dalam tingkat keparahan penyakit,” kata Saphire, yang memimpin Coronavirus Immunotherapy Consortium (CoVIC) yang didukung oleh Gates Foundation.

Korber mencatat, “Temuan ini menunjukkan bahwa bentuk virus yang lebih baru mungkin lebih mudah ditularkan daripada bentuk aslinya – terlepas dari apakah kesimpulan itu akhirnya dikonfirmasi atau tidak, ini menyoroti nilai dari ide-ide yang sudah bagus: memakai masker dan untuk menjaga jarak sosial. “

Mitra peneliti dari Los Alamos National Laboratory, Duke University, dan University of Sheffield pada awalnya menerbitkan karya analisis ini di situs bioRxiv dalam pracetak April 2020. Pekerjaan itu juga termasuk pengamatan pasien COVID-19 dari Sheffield yang menunjukkan hubungan varian D614G dengan viral load yang lebih tinggi di saluran pernapasan bagian atas.

“Ini memungkinkan untuk melacak evolusi SARS-CoV-2 secara global karena para peneliti di seluruh dunia dengan cepat membuat data urutan virus mereka tersedia melalui database urutan virus GISAID,” kata Korber. Saat ini puluhan ribu sekuens tersedia melalui proyek ini, dan ini memungkinkan Korber dan tim peneliti mengidentifikasi kemunculan varian D614G.

GISAID didirikan untuk mendorong kolaborasi di antara peneliti influenza, tetapi pada awal epidemi, konsorsium tersebut membentuk database SARS-CoV-2, yang segera menjadi standar de facto untuk berbagi urutan wabah di antara peneliti di seluruh dunia.

Studi, “Melacak perubahan dalam SARS-CoV-2 Spike: bukti bahwa D614G meningkatkan infektivitas virus COVID-19” didukung oleh Medical Research Council (MRC) bagian dari UK Research & Innovation (UKRI the National Institute of Health Research (NIHR); Genome Research Limited, beroperasi sebagai Wellcome Sanger Institute; CoVIC, INV-006133 dari COVID-19 Therapeutics Accelerator, didukung oleh Bill and Melinda Gates Foundation, Mastercard, Wellcome; dukungan filantropi swasta, serta Overton keluarga; FastGrant, dari Emergent Ventures, untuk membantu penelitian COVID-19; dan National Institute of Allergy and Infectious Diseases, National Institutes of Health, Department of Health and Human Services, di bawah Interagency Agreement No. AAI12007-001-00000, dan program Penelitian dan Pengembangan Laboratorium Los Alamos.

Penulis studi tambahan termasuk S. Gnanakaran, H. Yoon, J. Theiler, W. Abfalterer, N. Hengartner, EE Giorgi, T. Bhattacharya, B. Foley, KM Hastie, MD Parker, DG Partridge, CM Evans, TM Freeman, TI de Silva, C. McDanal, LG Perez, H. Tang, A. Moon-Walker, SP Whelan, CC LaBranche.

Untuk Informasi Lebih lanjut silahkan Kunjungi : Slot Online

Author Image
adminProzen